プログラムをコンパイルするときにconfig90.hとconfig.hに定義されているnsymqを必要な数に増やしてコンパイルしてください。なお、全部をコンパイルし直す必要はありません。これに依存するのは、cgmrpt.F90, inipot.F90, vbpef.F90, vbstm.F90, wannier.F90, wfn2chg.F90, mdrpt.F90, xticonv.F90, pefcos.F, hmatr2bnd.F90になりますので、これらの対応するオブジェクトファイルのみを消して再コンパイルすれば問題ありません。